MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 plasmid pMJ100

Total Repeats: 491

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011185	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011185	CTTTT	2	10	19	28	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011185	T	8	8	25	32	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011185	T	7	7	40	46	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011185	CTTTTT	2	12	47	58	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011185	T	8	8	54	61	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011185	TGT	2	6	134	139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011185	GTG	2	6	159	164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011185	CTA	2	6	188	193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011185	T	7	7	220	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011185	AGT	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011185	GAAC	2	8	298	305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011185	TCTACT	2	12	327	338	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011185	AGAC	2	8	458	465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011185	CTG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011185	AGAC	2	8	492	499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011185	CTG	2	6	505	510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011185	AAACC	2	10	525	534	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011185	ATT	2	6	799	804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011185	A	8	8	813	820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011185	T	6	6	824	829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011185	TAC	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011185	A	8	8	873	880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011185	AT	3	6	914	919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011185	ATT	2	6	953	958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011185	TA	3	6	1013	1018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011185	TAAC	2	8	1136	1143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011185	AAC	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011185	T	6	6	1157	1162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011185	ATTG	2	8	1205	1212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011185	AGAA	2	8	1267	1274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011185	TAA	2	6	1299	1304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011185	TTA	2	6	1346	1351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011185	TTAC	2	8	1411	1418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011185	TTAT	2	8	1434	1441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011185	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011185	TGTT	2	8	1517	1524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011185	T	7	7	1531	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011185	TA	3	6	1623	1628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011185	A	6	6	1652	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011185	TAAAA	2	10	1664	1673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011185	A	6	6	1686	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011185	A	6	6	1708	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011185	GAA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011185	TTA	2	6	10025	10030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011185	ATTT	2	8	12957	12964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011185	TTATT	2	10	13040	13049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011185	T	6	6	13072	13077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011185	TGT	2	6	13116	13121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011185	TA	3	6	14558	14563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011185	ATA	2	6	16753	16758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011185	TAA	2	6	17039	17044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011185	GAG	2	6	17074	17079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011185	AGATA	2	10	17083	17092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011185	T	7	7	17996	18002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011185	CAT	2	6	18045	18050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011185	T	7	7	18106	18112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011185	GTCC	2	8	19209	19216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011185	CTT	2	6	20417	20422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011185	ATA	2	6	20448	20453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011185	ATCA	3	12	20467	20478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011185	AT	3	6	20480	20485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011185	TTA	2	6	20488	20493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011185	T	6	6	20509	20514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011185	TAGT	2	8	24717	24724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011185	A	8	8	24731	24738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011185	T	7	7	25776	25782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011185	TGA	2	6	26255	26260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011185	TTC	2	6	26280	26285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011185	CTT	2	6	26292	26297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011185	GCT	2	6	26410	26415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011185	AT	3	6	26431	26436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011185	ATT	2	6	26468	26473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011185	AGT	2	6	26507	26512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011185	TTC	2	6	26539	26544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011185	TGTT	2	8	26550	26557	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011185	T	7	7	26556	26562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011185	GAT	2	6	26566	26571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011185	GA	3	6	26664	26669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011185	T	6	6	26683	26688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011185	T	6	6	26898	26903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011185	TTA	2	6	26941	26946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011185	ATC	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011185	TTTG	2	8	26958	26965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011185	G	7	7	27241	27247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011185	GT	3	6	27740	27745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011185	AAT	2	6	27993	27998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011185	ACTC	2	8	28073	28080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011185	ACT	2	6	29036	29041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011185	ATTTT	2	10	29046	29055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011185	T	6	6	29052	29057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011185	T	6	6	29080	29085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011185	A	6	6	29092	29097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011185	ATA	2	6	29105	29110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011185	TGG	2	6	29136	29141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011185	TTA	2	6	29249	29254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011185	TTC	2	6	31748	31753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011185	ATT	2	6	31766	31771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011185	CTC	2	6	31862	31867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011185	TTTA	2	8	31878	31885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011185	TTA	2	6	31900	31905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011185	GT	3	6	32433	32438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011185	TA	3	6	32500	32505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011185	TGAT	2	8	32520	32527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011185	T	6	6	32530	32535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011185	TTG	2	6	32549	32554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011185	TTG	2	6	33601	33606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011185	A	6	6	33616	33621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011185	ATC	2	6	33635	33640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011185	TTATG	2	10	33647	33656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011185	AT	4	8	33659	33666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011185	TAA	2	6	33697	33702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011185	TAC	2	6	33736	33741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011185	AAT	2	6	35046	35051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011185	TGCT	2	8	35503	35510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011185	TTGT	2	8	35529	35536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011185	TTTTA	2	10	35546	35555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011185	T	7	7	35567	35573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011185	T	6	6	35617	35622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011185	GTTATT	2	12	35631	35642	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011185	TAT	2	6	35648	35653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011185	ATA	2	6	36464	36469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011185	ATA	3	9	36478	36486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011185	TTAA	2	8	36495	36502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011185	TAA	2	6	36540	36545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011185	TGG	2	6	36558	36563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011185	TTGG	2	8	37853	37860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011185	ATTA	2	8	37862	37869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011185	A	6	6	37869	37874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011185	ATA	2	6	37905	37910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011185	T	7	7	38366	38372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011185	CTT	2	6	38435	38440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011185	GT	3	6	38470	38475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011185	GATAT	2	10	38497	38506	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011185	AAT	2	6	38514	38519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011185	A	7	7	42772	42778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011185	AAC	2	6	42789	42794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011185	ATC	2	6	42860	42865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011185	CATT	2	8	42943	42950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011185	T	6	6	44286	44291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011185	GATT	2	8	44345	44352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011185	GGT	2	6	44559	44564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011185	TTTA	2	8	44588	44595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011185	CAT	2	6	44626	44631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011185	ACG	2	6	44673	44678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011185	T	6	6	44693	44698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011185	A	6	6	44701	44706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011185	AAT	2	6	44722	44727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011185	AT	3	6	44735	44740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011185	CTA	2	6	44753	44758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011185	TTA	2	6	44769	44774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011185	TAA	2	6	44788	44793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_011185	T	6	6	56679	56684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_011185	GAC	2	6	169216	169221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_011185	TTAA	2	8	169236	169243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_011185	T	6	6	169289	169294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_011185	GAC	2	6	169315	169320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_011185	TGA	2	6	169493	169498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_011185	AAAT	2	8	169557	169564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_011185	ATTT	2	8	169649	169656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_011185	ACG	2	6	171200	171205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_011185	ATT	2	6	171232	171237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_011185	AGTA	2	8	171251	171258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_011185	GTTA	2	8	175216	175223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_011185	GTG	2	6	175767	175772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_011185	T	7	7	177105	177111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_011185	A	6	6	177112	177117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_011185	TCT	2	6	177906	177911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_011185	CAT	2	6	177912	177917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_011185	T	7	7	177930	177936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_011185	TATAA	2	10	177964	177973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_011185	A	6	6	177992	177997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.